В период с 13 по 19 сентября 2012 года в соответствии с приказом комитета образования Еврейской автономной области от 28.08.2012 № 498 «О проведении плановой выездной проверки соблюдения законодательства Российской Федерации в области образования областного государственного образовательного бюджетного учреждения для детей сирот и детей, оставшихся без попечения родителей «Детский дом № 3» отделом контроля и надзора в сфере образования в отношении ОГОБУ для детей сирот и детей, оставшихся без попечения родителей «Детский дом № 3» проведена плановая выездная проверка соблюдения законодательства Российской Федерации в области образования.
По результатам проверки составлен акт от 19.09.2012 № 51, предписание от 21.09.2012 № 2554/12. Срок исполнения предписания об устранении выявленных нарушений установлен до 07.03.2013 года.